Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms