Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
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Shroom4Q1W617 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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Shroom4Q1W617 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Shroom4Q1W617 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
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Shroom4Q1W617 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
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Shroom4Q1W617 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Shroom4Q1W617 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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