Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo3bQ1EG27 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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