Protein–RNA interactions for Protein: Q14B02

Rnf133, E3 ubiquitin-protein ligase RNF133, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf133Q14B02 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rnf133Q14B02 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf133Q14B02 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rnf133Q14B02 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf133Q14B02 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rnf133Q14B02 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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