Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gli2Q0VGT2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms