Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc162pQ0VG85 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms