Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930480E11RikQ0VG34 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms