Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2b3Q0VF55 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms