Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc21bQ0HA38 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttc21bQ0HA38 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms