Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnma1Q08460 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms