Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms