Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms