Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou6f1Q07916 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms