Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MestQ07646 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MestQ07646 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MestQ07646 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MestQ07646 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MestQ07646 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MestQ07646 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MestQ07646 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MestQ07646 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MestQ07646 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MestQ07646 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MestQ07646 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MestQ07646 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MestQ07646 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MestQ07646 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms