Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms