Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf4Q06507 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf4Q06507 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms