Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fmn1Q05860 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms