Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rcn1Q05186 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms