Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apoc2Q05020 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apoc2Q05020 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms