Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms