Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nf1Q04690 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nf1Q04690 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms