Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms