Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1sQ02789 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms