Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfiaQ02780 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms