Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnb1Q02248 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms