Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd1Q02242 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdcd1Q02242 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms