Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snai1Q02085 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms