Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms