Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms