Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HmgcrQ01237 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms