Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja5Q01231 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms