Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col1a2Q01149 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col1a2Q01149 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms