Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrcdQ00LT2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms