Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms