Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoa1Q00623 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa1Q00623 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms