Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb1Q00420 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms