Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PgrQ00175 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms