Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms