Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VldlrP98156 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VldlrP98156 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms