Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shc1P98083 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms