Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smn1P97801 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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