Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms