Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2cP97760 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2cP97760 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2cP97760 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2cP97760 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2cP97760 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2cP97760 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2cP97760 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2cP97760 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2cP97760 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2cP97760 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms