Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms