Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1bP97358 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf1bP97358 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms