Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mesp1P97309 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mesp1P97309 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms