Protein–RNA interactions for Protein: P81270

Erg, Transcriptional regulator ERG, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErgP81270 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ErgP81270 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ErgP81270 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ErgP81270 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ErgP81270 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ErgP81270 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ErgP81270 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErgP81270 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErgP81270 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErgP81270 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErgP81270 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErgP81270 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErgP81270 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErgP81270 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErgP81270 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErgP81270 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ErgP81270 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErgP81270 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ErgP81270 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms