Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otx2P80206 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otx2P80206 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx2P80206 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx2P80206 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otx2P80206 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms