Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ldb1P70662 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ldb1P70662 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms