Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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